История основания монастыря
Монастырь основан как мужской в 1635 году царём Михаилом Фёдоровичем в память своего отца — патриарха Филарета, скончавшегося в праздник Покрова Богородицы. Раньше на месте возведения монастыря находилось кладбище бездомных и странников, поэтому в первые века своего существования монастырь назывался также Божедомским или монастырём на Убогих Домах. Монастырь был достроен при царе Алексее Михайловиче за счёт средств, полученных благодаря сдаче в аренду землевладений, отчего в простонародье назывался также «комнатным».
Монастырь в XVII-XX веках
В 1655 году возведён каменный монастырский собор Покрова Богородицы. Он был полностью перестроен в 1806—1814 годах.
В XVIII веке возвели церковь Воскресения Словущего и 30-метровую трёхъярусную колокольню. С 1680 по 1731 годы Покровская обитель была приписана к Заиконоспасскому монастырю.
В войну 1812 года в монастыре жил французский генерал Мишель Клапаред, командующий Польским корпусом. В этом же году некоторые постройки монастыря были разрушены.
В 1855 году была освящена перестроенная по проекту Михаила Быковского церковь Воскресения Словущего, от храма XVIII века остались четыре подкупольных столпа с арками и восточная стена главного алтаря. Стены, не сохранившиеся с западной стороны, и ворота построены в 1833—1855 годах. Южная часть стены построена в 1886 году по проекту архитектора Василия Карнеева.
В конце XIX века, примерно с 1870 года, монастырь был преобразован в Покровский миссионерский монастырь. Православным миссионерским обществом в нём был создан миссионерский институт для подготовки монашествующих, желавших направиться в просветительские миссии. Миссионерский институт активно действовал только во времена архиерейства святителя Иннокентия, митрополита Московского, подготовив несколько десятков миссионеров.
Монастырь в XX веке
В 1926 году храмы монастыря закрыли и взорвали колокольню, а саму обитель закрыли в 1929. Последним наместником Покровского мужского монастыря был архимандрит Вениамин (Милов).
В 1934 году в западной части территории монастыря, на месте монастырского кладбища, был разбит парк культуры и отдыха Ждановского района (ныне Таганский парк), монастырские стены (ограда) в этой части были снесены. В зданиях же монастыря размещались типография, редакция журнала, спортивный зал, бильярдная, киностудия, управление кинофикации.
В 1994 году Покровский монастырь был возвращён Русской православной церкви. Именно тогда Священный Синод принял решение о возобновлении Покровского монастыря в качестве женской обители.
Возрождение обители началось в октябре 1995 года, тогда в стенах наполовину разрушенной Покровской церкви была отслужена первая Божественная литургия. Брат настоятельницы отец Александр сделал из фанеры первый иконостас, на котором укрепили бумажные иконы, сёстры сами и пели. В 1996—1997 годах постановлением правительства Москвы монастырю переданы в бессрочное и безвозмездное пользование сохранившиеся храмы, культовые постройки, другие здания и сооружения, исторически принадлежавшие Покровскому монастырю, а затем и монастырская земля — кроме той, что занимает Таганский парк со стадионом.
1 мая 1998 года в монастырь были перенесены останки Матроны Никоновой. Покровский монастырь стал центром распространения её почитания. 2 мая 1999 года Матрона Никонова была прославлена в лике местночтимых святых как «блаженная Матрона Московская». В 1999 году освящён верхний храм Покрова Пресвятой Богородицы. А 22 ноября 2001 года, в день 120-й годовщины рождения Матроны Московской, освящён Воскресенский собор. В 2002 году освящена вновь отстроенная трёхъярусная колокольня, точное подобие разрушенной.
Ежедневно монастырь посещают до 3 тысяч паломников, в воскресные и праздничные дни их число доходит до 25 тысяч, в дни престольных праздников — до 50 тысяч.